新冠研究
Octet平臺上的新冠研究
在賽多利斯，我們決心支持研究人員在全球范圍內(nèi)尋找SARS-Cov2病毒急需的治療方法和疫苗。作為我們承諾的一部分，我們已編譯了鏈接和資源，以獲取更多信息。您可以在“資源”選項中找到有關(guān)最新出版物中如何使用我們的Octet系統(tǒng)用于新冠研究的介紹。自2020年1月首次共享COVID-19序列以來，Octet系統(tǒng)數(shù)據(jù)已在與冠狀病毒生物學(xué)，疫苗和抗病毒治療發(fā)展有關(guān)的幾篇突破性出版物中得到了體現(xiàn)。
Octet新冠研究
下表提供了一些重要的研究文章，其中Octet系統(tǒng)在闡明COVID-19病毒顆粒的結(jié)合動力學(xué)和親和力、中和作用、交叉阻斷作用或效價方面發(fā)揮了作用。當(dāng)有新信息可用時，我們將更新此表和此頁面上的其他信息以提供最新信息。
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分析物 |
偶聯(lián)配體 |
病毒種屬 |
分析焦點 |
生物傳感器 |
參考文獻(xiàn) |
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ACE2 |
Fc-tagged SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
交叉反應(yīng)和受體結(jié)合 |
AHC |
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ACE2 |
SARS-CoV-2 SB SARS-CoV SB |
SARS CoV-2 |
受體結(jié)合 |
HIS1K |
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mAb, MERS S protein, VHH |
SARS CoV-2 S1, SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
VHH和mAb結(jié)合評估，抗原表位分組 |
AR2G |
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Fab, IgG |
SARS CoV-2 S protein, SARS CoV-2 RBS |
SARS CoV-2 |
FAB，IgG結(jié)合表征 |
HIS1K |
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ACE2, SARS-CoV RBD |
SARS-CoV特異性中和抗體 |
SARS CoV-2 |
交叉反應(yīng)結(jié)合 |
SA |
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抗體 |
生物素化重組SARS-CoV S1蛋白 |
SARS CoV-2 |
中和抗體評估 |
SA |
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FAB, ACE2, SARS S protein |
mAb, ACE2 |
SARS CoV-2 |
受體結(jié)合，抗體活性，競爭分析 |
AHC, HIS1K |
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SARS CoV-2 RBD |
抑制劑多肽 |
SARS CoV-2 |
多肽抑制劑開發(fā) |
SA |
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mAb |
S1B and SARS Secto domains |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
抗體活性評估 |
HIS1K |
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SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD, mAbs, FAB |
mAbs, SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
抗體結(jié)合表征，表位分組，競爭結(jié)合 |
Protein A, HIS2, HIS1K |
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新冠病毒S蛋白 |
Biotin-9OAc6SLN |
SARS CoV and MERS CoV |
受體結(jié)合 |
SA |
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MERS-5HB fusion inhibitor |
生物素化多肽(MERS-HR2P) |
MERS CoV |
蛋白質(zhì)抑制劑開發(fā) |
SA |
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mAb, MERS S protein |
mAb, MERS S protein |
MERS CoV |
抗原表位分組和受體結(jié)合 |
SAX, Protein A |
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MERS-CoV S |
mAbs |
MERS CoV |
抗體活性測定，競爭分析 |
AHC, HIS1K |
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MERS-CoV NTD, mutants |
mAb |
MERS CoV |
抗體活性測定 |
AHC |
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MERS S-protein |
mAbs |
MERS CoV |
抗體活性測定 |
AHC |
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RBD,S1,S2 domains |
疫苗誘導(dǎo)的小鼠單克隆IgG |
MERS CoV |
抗體活性與表位結(jié)合 |
AHC, HIS1K |
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FABs |
MERS-CoV RBD |
MERS CoV |
抗原表位分組 |
HIS1K |
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RBD |
ACE2 |
SARS-CoV-2 |
結(jié)合親和力 |
AHQ |
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多重特異性、多重親和力的抗體 |
RBD |
SARS-CoV-2 |
結(jié)合親和力 |
NTA |
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ACE2 |
RBD |
SARS-CoV-2 |
抗體結(jié)合表征，表位鑒定分析，競爭結(jié)合實驗 |
Protein A |
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r-spike ecto protein, IgGs |
mAb, Spike ectodomain protein |
SARS-CoV-2 |
抗體結(jié)合表征，表位鑒定分析，競爭結(jié)合實驗 |
AMC, SA |
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IgGs |
RBD |
SARS-CoV-2 |
表位鑒定分析 |
AHC |
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ACE2-PD, B38 Ab |
P2 S |
SARS-CoV-2 |
BNT162b2（mRNA疫苗）表達(dá)產(chǎn)物與受體及中和抗體的親和力 |
SA, Protein G |
Octet-BLI平臺為協(xié)助科學(xué)家加速新冠研究，可提供：
- 高通量動力學(xué)相互作用分析解決方案，快速選擇抗原靶點、疫苗和治療候選方案
- 用于抗體表位鑒定和覆蓋度測定的快速靈活平臺
- 為疫苗和生物治療開發(fā)研究量身定制的高效工作流程并配有廣泛的生物傳感器
- 上游和下游疫苗開發(fā)和生產(chǎn)的通用解決方案，如疫苗效力、穩(wěn)定性和效價測量
- 直觀易用的數(shù)據(jù)分析軟件工具
結(jié)合動力學(xué)表征
據(jù)報告，上海復(fù)旦大學(xué)的Ying等人與武漢病毒研究所的其他人員合作，評估抗冠狀病毒抗體與新型冠狀病毒刺突蛋白的交叉反應(yīng)，因為新型冠狀病毒和冠狀病毒中受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域（RBD）具有高度一致性。他們首次報告中使用Octet系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)，冠狀病毒特異性人單克隆抗體CR3022可與新型冠狀病毒RBD（KD為6.3nM）有效結(jié)合。此類結(jié)果對最終開發(fā)有效的抗病毒治療劑和疫苗至關(guān)重要。
Joyce等人使用新型冠狀病毒S RBD的高分辨率晶體結(jié)構(gòu)報告了類似的觀察結(jié)果。使用Octet系統(tǒng)檢測已知與冠狀病毒和MERS冠狀病毒RBD相互作用的抗體和新型冠狀病毒結(jié)合活性。只有兩種抗體240CD和CR3022對新型冠狀病毒RBD的低nM結(jié)合親和力。
復(fù)旦大學(xué)的Ying等人發(fā)表過另一篇文章，描述靶向新型冠狀病毒RBD的單域抗體的產(chǎn)生和檢測。使用新型冠狀病毒RBD和S1作為抗原進(jìn)行淘選，鑒定出靶向RBD新型冠狀病毒上五種類型中和或非中和表位的抗體。選擇其中18例，以供進(jìn)一步研究。應(yīng)用生物層干涉技術(shù)（BLI）和ELISA測定，發(fā)現(xiàn)其與新型冠狀病毒RBD有效且特異性結(jié)合，其中親和力為亞nM級至nM級。
快速測定病毒結(jié)合和交叉反應(yīng)性
在關(guān)于靶向新型冠狀病毒RBD的單域抗體的文章中，Ying等人在使用Octet系統(tǒng)的競爭結(jié)合測定中檢測18種人單域抗體，并發(fā)現(xiàn)可將其分成三個競爭組（A組、B組或C組）-彼此無任何競爭表現(xiàn)。
洞察新冠肺炎（COVID-19）結(jié)合表位
Octet平臺技術(shù)正在幫助世界各地的科學(xué)家了解更多有關(guān)新冠肺炎疫情的信息。在本資料中，我們重點介紹許多病例中的兩個。作為開發(fā)疫苗的第一步，研究人員正在使用Octet系統(tǒng)來了解病毒結(jié)合機(jī)制。
一種快速、高精密度的流感疫苗效力測定法
在生產(chǎn)過程中快速、準(zhǔn)確地測定疫苗滴度對了解疫苗開發(fā)流程性能以及正確調(diào)整每個流程步驟很重要。Octet平臺憑借96孔或384孔板格式的高通量特性，提高了精確度和重現(xiàn)性，是一種更簡單、更直接的疫苗/抗原-抗體結(jié)合測量方法。他們?yōu)榱鞒涕_發(fā)組提供一個強(qiáng)大且易于使用的SRID替代方法。對于96孔板樣本，Octet平臺將測定時間從數(shù)天縮短至幾小時。
適配體團(tuán)隊利用Octet Red384獲得準(zhǔn)確結(jié)果
過去幾個月的研究強(qiáng)調(diào)，新型冠狀病毒的S1蛋白是主要治療靶點。適配體團(tuán)隊成功分離出一種可選擇性結(jié)合新型冠狀病毒刺突S1蛋白的單克隆適配體。他們使用Octet Red384系統(tǒng)檢測抗新型冠狀病毒及相關(guān)病毒的適配體，也鑒定在不同位點結(jié)合蛋白的適配體。
全球新冠研究
由世界衛(wèi)生組織（WHO）收集并每日更新的關(guān)于新冠的全球研究。世衛(wèi)組織新冠文獻(xiàn) - 世衛(wèi)組織新冠文獻(xiàn)
艾倫人工智能研究所與領(lǐng)先的研究小組合作，準(zhǔn)備和分發(fā)新冠開放式研究數(shù)據(jù)集（CORD-19）。有超過52,000篇學(xué)術(shù)文章的免費資源，包括41,000多篇關(guān)于新冠和冠狀病毒家族的文章，供全球研究界使用。在線的全文搜索數(shù)據(jù)庫可以通過以下鏈接訪問。還可以在病毒研究中進(jìn)行搜索引用Octet產(chǎn)品使用的出版物。 - 人工智能數(shù)據(jù)庫
一份為研究人員、非營利組織和商業(yè)組織，特別是針對新冠和冠狀病毒相關(guān)研究的開放式資助電話和其他支持的精心策劃的清單，每天都會進(jìn)行維護(hù)和更新。- 資助監(jiān)督
美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）列出了所有與冠狀病毒相關(guān)的資助機(jī)會。 - 來自美國國立衛(wèi)生研究院的資助
