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基于片段藥物發(fā)現(xiàn)的高通量SPR

  • 高通量片段藥物發(fā)現(xiàn) - Pioneer FE系統(tǒng)采用了高通量模式,借助獨(dú)有的單次進(jìn)樣方式,可以在24小時(shí)內(nèi)測試768種分析物的動(dòng)力學(xué)/親和力。專用系統(tǒng)軟件包含苗頭化合物選擇功能,用于歸一化、合并和分析化合物片段或其它篩選數(shù)據(jù)集,以準(zhǔn)確選擇苗頭化合物。
  • 簡化動(dòng)力學(xué)表征 - 通過OneStep單次進(jìn)樣模式,用戶可以從單一分析物濃度中獲得準(zhǔn)確的動(dòng)力學(xué)和親和力值,無需進(jìn)行多濃度分析物測試,從而節(jié)省時(shí)間,減少稀釋時(shí)的相關(guān)誤差。NextStep進(jìn)樣模式提供了一種簡捷的工作流程,通過表征配體的競爭性結(jié)合物,揭示反應(yīng)的作用機(jī)制。
  • 極低的基線噪音與基線漂移、高檢測靈敏度以及高達(dá)40 Hz的數(shù)據(jù)采集頻率 - 對于高親和力以及其他挑戰(zhàn)性的結(jié)合物樣本,極低的基線噪音與基線漂移可確保在檢測過程中獲取可靠的動(dòng)力學(xué)和親和力數(shù)值。憑借高達(dá)40 Hz的數(shù)據(jù)采集能力,Pioneer FE系統(tǒng)能夠準(zhǔn)確捕捉各種生物分子和小分子片段的極為快速的動(dòng)力學(xué)結(jié)合和解離變化。

Pioneer SPR系統(tǒng)可提供高質(zhì)量的動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)(ka, kd)和親和力測量(KD)數(shù)據(jù),對小分子片段到生物制劑等各種生物分子的相互作用進(jìn)行表征。OneStep SPR進(jìn)樣可加快測定工作流程,利用單個(gè)分析物的濃度便足以進(jìn)行準(zhǔn)確的動(dòng)力學(xué)和親和力測定。

三通道、全自動(dòng)SPR系統(tǒng)

利用三個(gè)傳感通道,可以同時(shí)分析兩個(gè)靶蛋白或配體的結(jié)合,另一個(gè)被用作參考通道。

長達(dá)72小時(shí)的無人值守運(yùn)行

提供豐富的樣品容器類型,最多可容納兩個(gè)384孔板,可實(shí)現(xiàn)72小時(shí)無人值守運(yùn)行,完成大規(guī)模結(jié)合篩選。

利用QDat軟件實(shí)現(xiàn)快捷的數(shù)據(jù)分析

Pioneer SPR系統(tǒng)配備了基于Scrubber和Clamp平臺(tái)的經(jīng)行業(yè)驗(yàn)證的集成數(shù)據(jù)分析軟件。支持將多個(gè)不同實(shí)驗(yàn)、不同天數(shù)以及不同傳感器的原始數(shù)據(jù)予以疊加并分析,如單位點(diǎn)和多位點(diǎn)結(jié)合、質(zhì)量遷移以及不可逆抑制劑分析等。

以更少的樣品用量獲得更多數(shù)據(jù)內(nèi)容

在OneStep進(jìn)樣生成分析物梯度的過程中,通過對擴(kuò)散系數(shù)的計(jì)算用以評(píng)估樣品的聚集,使用戶僅需一次進(jìn)樣就能獲取有關(guān)動(dòng)力學(xué)、親和力信息以及聚集信息。

穩(wěn)固的流路設(shè)計(jì)

Pioneer 流體系統(tǒng)由PEEK、陶瓷或Tefzal等惰性材料制成,具有優(yōu)良的耐用性和低維護(hù)成本。

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應(yīng)用

化合物片段篩選

基于片段的藥物設(shè)計(jì)已成為一種主流的藥物開發(fā)技術(shù),用于識(shí)別藥物開發(fā)項(xiàng)目中的潛在候選對象。可檢測低分子量化合物以及低親和力相互作用的超靈敏生物物理技術(shù),使得檢測和表征化合物片段成為可能。表面等離子共振(SPR)技術(shù)已成為鑒定這些低親和力片段化合物的核心技術(shù)之一。基于SPR的生物傳感器(例如Pioneer FE)具有無與倫比的靈敏度和通量,對于單個(gè)藥物靶點(diǎn),可以在短短幾周內(nèi)對包含數(shù)千種化合物的庫進(jìn)行完整的片段篩選。

表征高親和力抗體相互作用

無論分子類型如何,靶標(biāo)結(jié)合表征都是選擇高親和力(KD <1 nM)和高特異性生物藥物必不可少的分析步驟。動(dòng)力學(xué)分析則進(jìn)一步描述了形成整體親和力相互作用的結(jié)合和解離這兩個(gè)相關(guān)因素。例如,兩種先導(dǎo)化合物可能與其靶標(biāo)具有相似的親和力(KD),但是它們在結(jié)合和解離動(dòng)力學(xué)速率常數(shù)上的差異可用于評(píng)估哪一個(gè)在體內(nèi)將是更為有效的化合物。因此,獲取準(zhǔn)確的動(dòng)力學(xué)速率常數(shù)分析數(shù)據(jù),對于先導(dǎo)化合物的選擇和預(yù)測蛋白藥物的功效來說是重要的信息。

通過一步進(jìn)樣法來確定動(dòng)力學(xué)和親和力數(shù)據(jù),具有新一代進(jìn)樣模式的Pioneer SPR系統(tǒng)相較于傳統(tǒng)SPR可大幅提高表征過程的效率。依托Pioneer平臺(tái)的新一代OneStep梯度進(jìn)樣可顯著提升親和力表征的速度,同時(shí)保持結(jié)果的準(zhǔn)確性和高可信度。

閱讀應(yīng)用指南

表征不可逆抑制劑并測定共價(jià)結(jié)合

使用無標(biāo)記實(shí)時(shí)生物傳感器技術(shù)進(jìn)行測試的大多數(shù)小分子抑制劑測定方法都是可逆的相互作用,具有常用的動(dòng)力學(xué)速率模型。但是,市面上相當(dāng)一部分治療性酶抑制劑利用靶標(biāo)的共價(jià)修飾功能發(fā)揮作用。

Pioneer屬于一種SPR平臺(tái),能夠與可再生鏈霉親和素生物傳感器配合使用,以可逆的方式捕獲蛋白靶標(biāo)并量化共價(jià)抑制劑與靶標(biāo)結(jié)合的效率。Pioneer系統(tǒng)的不可逆抑制劑應(yīng)用方法可用于確定抑制劑化合物的共價(jià)結(jié)合,作為不可逆抑制劑的指標(biāo)。

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特刊

Label-Free Detection technologies, key considerations and applications cover

非標(biāo)記檢測技術(shù):關(guān)鍵考量和應(yīng)用

生物樣品中的結(jié)合作用是動(dòng)態(tài)的,受環(huán)境變化的驅(qū)動(dòng)。表征這類相互作用的技術(shù)必須能夠反映相應(yīng)的生物復(fù)雜性。

折光率范圍

1.33–1.40

短期基線噪音

< 0.035 RU

檢測分子量下限

< 70 Da

檢測范圍ka?102?– 109?M-1?s-1
kd?10-6?– 2.5 s-1
KD?~10-3?– 10-12?M
濃度 ~10-3?– 10-12?M
樣品架數(shù)量2個(gè)樣品架
樣品規(guī)格96孔板(常規(guī)/深孔/PCR),384孔板
樣品溫控4至40°C(低于室溫15°)
樣品進(jìn)樣全自動(dòng)
通道數(shù)

3

流路體積

1, 1–2, 1–2–3, 3, 3–2, 3–2–1

實(shí)時(shí)減扣參比曲線

進(jìn)樣體積

2–700 μL

同時(shí)進(jìn)樣可支持兩個(gè)樣品同時(shí)進(jìn)樣
緩沖液在線脫氣

系統(tǒng)溫控4至40°C(低于室溫15°)
數(shù)據(jù)采集頻率

1–40 Hz

自動(dòng)化能力> 72小時(shí)無人值守運(yùn)行
Qdat苗頭化合物選擇功能

高通量篩選模式

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